NOS SPÉCIALISATIONS

Face au constat d’un besoin grandissant d’expertise dans les domaines –Omics, nous avons bâti un savoir-faire dans la collecte, l’analyse et la valorisation des données issues des technologies de pointes (séquençage/NGS, qRT-PCR, RMN etc.).
Nous offrons un service sur-mesure, ponctuel ou sur la totalité de vos projets (de la conception de protocole au rapport final d’analyse).

L’expertise Soladis vous garantit :

• une analyse personnalisée et de qualité de vos données –omics,
• l’accompagnement dans la valorisation de vos données, toute technologie et domaine confondu (génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique).

L’offre OMICS de Soladis permet d’augmenter la chaîne de valeur de traitement de vos données à des niveaux biologiques multiples: du séquençage des gènes à l’expression des protéines et des structures métaboliques.
A l’instar des autres BU Soladis, nous opérons dans des domaines d’applications variés : problématiques humaines, animales, végétales, jusqu’à l’étude de microorganismes appliqués à des défis environnementaux par exemple.

ADN

Génomique
• Séquençage de génome entier (WGS), Séquençage d’exome entier (WES), Séquençage de novo,
• Contrôle qualité / Nettoyage de données
• Génotypage, SNP, réarrangements ADN
• Identification in silico/analyse de biomarqueurs & gènes d’intérêts
• Annotation (structurale et fonctionnelle) et annotation de génomes
• Génomique comparative
• Reconstruction métabolique

Epigénétique
• Etude des modifications ADN : Méthylation ADN, modification d’histones, interaction ADN-protéines à partir de données ChIP-seq, ChIP-onChIP, Hi-C et plus.

Métagénomique
• Analyse génomique de microbiote (caractérisation de la diversité microbienne, recherche de gènes d’intérêts dans la résistance aux Ab ou virulence)
• Analyses fonctionnelles (Shotgun)
• Métatranscriptomique

ARN

Transcriptomique et métatranscriptomique
• Analyse de profils d’expressions différentiels issus de RNA-Seq, qPCR
• Détection de faibles niveaux d’expression ARN issus de single cell RNA-Seq
• Interactions ARN-protéine (CLIP-Seq)
• Identification in silico / analyse de biomarqueurs
• Profils d’épissage
• ARN non codants, mi-RNA, ARN circulants libres (cfDNA)
• Analyse fonctionnelle de signatures

PROTEOMIQUE

• Détermination de séquences protéiques
• Analyses d’expressions différentielles
• Analyses structurales
• Analyses de datas cytométrie en flux, RMN
• Design et optimisation de protéines
• Identification in silico/analyse de biomarqueurs

METABOLIQUE

• Analyses de métabolites à partir de données issues de spectrométrie de masse, RMN

• Cartographie métabolique